新しいゲノム異常が導く心不全 -――ゲノムの構造異常とは何か？

Structural variants in primary cardiomyopathy

　拡張型心筋症（DCM）は遺伝学的検査が管理の基盤で，既知遺伝子の病的バリアントは約40％に検出されるが，陰性例でも家族歴があり未解明因子（missing heritability）が示唆される．候補のひとつが構造変異（SV）である．ショートリードシークエンス（SRS）は一塩基置換（SNV）や数塩基の挿入・欠失（indel）に強い一方，SVの多くが500bp超でSRSの可読長を超え，またエクソン中心（全ゲノムの約1％）の設計のため，ブレイクポイントを捉えにくい．SVの検出法としては，MLPAによりエクソン欠失・重複を簡便に行えるほか，ロングリードシークエンス（LRS）によりブレイクポイント，非コード領域，逆位を解析することが可能となった．さらに，これらの解析手法を用いる症例の特定に，SRSデータからSVを予測するツールが開発され，近年の研究では代表的な心筋症遺伝子におけるSVの存在が報告され，遺伝診断の精度向上の余地を示している．