コンピュータによる遺伝子の機能の推定―がん遺伝子を中心に

Computer-assisted analysis of oncogene product

　最近コンピュータを利用して，特定の遺伝子に相同な遺伝子をデータベース中に探査する，いわゆる「ホモロジー探査」が分子生物学者の間に普及しつつある。このコンピュータ法は，がん遺伝子などにしばしば見られるように，細胞の表現型の変化が特定の遺伝子上の変異に起因することが理解できているが，その遺伝子の生化学的機能が同定できていない場合，あるいは合成プローブなどでcDNAを単離した場合，など機能未同定遺伝子に対して，その機能を示唆する上でとくに有効である場合がある。ここでは二つの方法，すなわちホモロジー探査法と分子系統樹による機能の推定法について，がん遺伝子あるいはがん関連遺伝子を中心に述べてみたい。前者の一部はすでに普及しているが，後者はまだ試みの段階である。ここで述べる方法が，がん研究の一助となれば幸いである。