BAF―低分子量DNA結合タンパク

　BAF（Barrier-to-autointegration factor）は1998年に遺伝子がクローニングされた分子であり^1），約90アミノ酸から成る分子量10kDの低分子量DNA結合タンパク質で，これまでのところ多細胞動物にのみ存在が確認されている。BAFは，白血病ウイルスやエイズウイルスなどのレトロウイルスが宿主細胞に感染後に形成するプレインテグレーション複合体を構成する宿主細胞性由来の因子として見つかった分子である。in vitroではBAFは逆転写により形成されたウイルスDNAに結合し，ウイルスDNA間でインテグレーションが起こること（autointegration）を阻害する活性を持つことが明らかになっており，これがBarrier-to-autointegration factorと命名された所以である^1）。

　また，BAFにはウイルスゲノムを宿主ゲノムへインテグレーションさせるインテグレースを活性化する機能もある。その活性化能力は，これまで見つかっている同様な機能を持つ細胞性のタンパク質HMG A1（high-mobility group protein A1）より500倍以上高いことも知られている^2）。BAFはタンパク質の構造内にhelix-hairpin-helix構造を持ち，塩基配列には依存せず2本鎖DNAに特異的に結合する特性がある。水溶液中では，ダイマーを形成し異なる2本鎖DNA間を架橋する機能が強く，21塩基対のDNAを用いた解析ではドデカマーの大きな複合体を形成することが示されている^3）。宿主細胞性由来の因子であるBAFが，どうしてこのようにレトロウイルスの増殖に寄与するかについてはまだ詳細は明らかではない。