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Seitai no Kagaku Volume 58, Issue 5 （October 2007）

生体の科学 58巻5号（2007年10月発行）

Japanese English

特集タンパク質間相互作用

5．遺伝情報の発現

生体ネットワークにおけるタンパク質間相互作用の研究法 Md. Altaf-Ul-Amin ¹ , 和田眞昌 ¹ , 西潟憲策 ² , 旭弘子 ¹ , 黒川顕 ¹ , 金谷重彦 ¹ Md. Altaf-Ul-Amin ¹ , Masayoshi Wada ¹ , Kensaku Nisikata ² , Hiroko Asahi ¹ , Ken Kurokawa ¹ , Shigehiko Kanaya ¹ ¹奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科 ²NECソフト（株） pp.391-394

発行日 2007年10月15日 Published Date 2007/10/15

DOI https://doi.org/10.11477/mf.2425100075

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参考文献 Reference

　ゲノムプロジェクトの進展とともに明らかにされたゲノムに存在する遺伝子をもとに，トランスクリプトーム，プロテオーム，インタラクトーム，メタボロームさらにはフィジオーム研究への展開がなされ，大量情報を考慮したそれぞれのオーム解析における数理解析法の開発が必要とされている中で，プロテオーム情報としてのタンパク質間の相互作用データが測定され^1-5），データベース化されている^6,7）。タンパク質-タンパク質相互作用に関わる大量情報を網羅的かつ悉皆的に把握することは，細胞内におけるタンパク質の関係を明らかにできることから，タンパク質を要素，タンパク質-タンパク質相互作用を関係とみなしたシステムとして分子生物学を体系的に理解するために重要である。筆者らの研究室では，タンパク質-タンパク質相互作用データをもとに，お互いの相互作用が密であるタンパク質の集合を抽出する数理科学法（DPClus）を提案し，タンパク質について複合体の予測を試みた^8,9）。本解説では，DPClusのアルゴリズムおよびその適応例について紹介する。なお，DPClusはウエブより無償でダウンロードできる（http://kanaya.naist.jp/DPClus/）。