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連載 バイオインフォマティクスの世界・第7回
バイオインフォマティクスの根幹を担うデータベース
Databases as the foundation of bioinformatics
奥田 修二郎
1
Shujiro OKUDA
1
1新潟大学医学部メディカルAIセンター
キーワード:
データベース
,
パスウェイ
,
リポジトリ
,
オントロジー
Keyword:
データベース
,
パスウェイ
,
リポジトリ
,
オントロジー
pp.784-789
発行日 2022年5月14日
Published Date 2022/5/14
DOI https://doi.org/10.32118/ayu28107784
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SUMMARY
ゲノム解析をはじめ多様なオミクスデータの解析をする際に,IDのみで記述されたデータから遺伝子名を知りたい,といったような要求がでてくることはよくある.その場合,遺伝子名とIDとの関連について記述されたデータベースからそれらの情報を引き出して計算機で適切に処理するというプロセスが必要となる.このように,データ解析をする際にはそのデータだけがあれば完結するわけではなく,さまざまなその他の情報と合わせて解析することが非常に多い.多様な情報があらかじめまとめられているデータベースがあることで,人が理解する場合に役に立つだけでなく,計算機での処理も容易にすることができる.本稿ではデータ解析にとって非常に重要な役割を担っているデータベースについて紹介する.
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