Japanese
English
連載 バイオインフォマティクスの世界・第6回
グライコインフォマティクス(糖鎖インフォマティクス)
Glycoinformatics
細田 正恵
1
,
小野 多美子
1
,
木下 聖子
1
Masae HOSODA
1
,
Tamiko ONO
1
,
Kiyoko F. AOKI-KINOSHITA
1
1創価大学糖鎖生命システム融合研究所
キーワード:
糖鎖関連データ
,
リポジトリ
,
ポータルサイト
,
糖鎖関連遺伝子
,
糖鎖関連疾患
Keyword:
糖鎖関連データ
,
リポジトリ
,
ポータルサイト
,
糖鎖関連遺伝子
,
糖鎖関連疾患
pp.349-355
発行日 2022年4月23日
Published Date 2022/4/23
DOI https://doi.org/10.32118/ayu28104349
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SUMMARY
糖鎖インフォマティクスでは,ゲノムやプロテオーム解析として発展したバイオインフォマティクス分野と同様に,糖鎖構造同定の網羅的解析であるグライコミクス解析や糖鎖を扱うデータの形式化,データベースの構築が行われている.糖鎖は,発生,免疫,感染,神経などあらゆる生命現象に関与しており,バイオマーカーとしても利用されている.また,糖鎖を利用した創薬研究も注目され,医療診断や治療に期待されている生体分子である.しかし,糖鎖インフォマティクスにおける糖鎖データの整理や連携には課題もあるが,本稿では,現在利用・公開されている糖鎖データの主な構造の表現法や実験データをもとに可視化するツールについて触れる.また,糖鎖生物学研究者により実験で同定された糖鎖関連データのリポジトリや,さまざまな糖鎖データベースを統合したポータルサイトおよびその連携についても紹介する.
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