Japanese
English
骨・関節感染症の治療戦略 Ⅲ.検査・診断
2.分子生物学的検査
Next generation sequencing(NGS)を用いた基礎的検討および慢性骨髄炎患者検体の解析結果より考えるNGSの有用性と課題
Usefulness and challenges of next generation sequencing(NGS):using clinical study of chronic osteomyelitis and analysis of basic study
植田 成実
1
,
飯田 寛和
2
,
齋藤 貴徳
3
N. Ueda
1
,
H. Iida
2
,
T. Saito
3
1関西医科大学総合医療センター整形外科/ゲノム解析センター
2関西医科大学リハビリテーション学部
3関西医科大学整形外科
1Dept. of Orthop. Surg. and Genome Analysis Center, Kansai Medical University Medical Center, Moriguchi
キーワード:
next generation seguencing
,
quantitative real-time polymerase chain reaction
,
chronic orthopaedic infection
Keyword:
next generation seguencing
,
quantitative real-time polymerase chain reaction
,
chronic orthopaedic infection
pp.79-84
発行日 2022年4月25日
Published Date 2022/4/25
DOI https://doi.org/10.15106/j_besei81_79
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は じ め に
超音波処理による培養検査を行うことでバイオフィルム内の生菌検出を向上できる1)が,休眠状態の細菌は検出できない2,3).われわれは,このようなバイオフィルム内の培養困難な細菌検出を目的として,人工関節周囲感染(periprosthetic joint infection:PJI)や骨・軟部組織感染症におけるnext generation sequencing(NGS)4,5)を超音波処理法1)と併せて行うことを考案し,2015年より検討している(図1)5,6).
最新のMusculoskeletal Infection Society(MSIS)によるPJI診断ガイドラインでは,診断未確定の症例にNGSを考慮することを注訳として記載されている7).しかし,手術中摘出された臨床検体は採取箇所や検体種により細菌濃度の低いものが存在し1),NGSにおいて偽陽性や偽陰性の要因となる5,6).
本稿では基礎的検証に加え,超音波処理による血液培養ボトル併用の培養検査1)が陰性であった慢性骨髄炎患者のNGS検証結果を報告する.
© Nankodo Co., Ltd., 2022