Japanese
English
特集 診断・治療に難渋したPeriprosthetic Joint Infectionへの対応
診断編
—細菌培養陰性例への対応—Next-generation Sequencingの現状と可能性
Correspondence to Periprosthetic Joint Infection Cases of Negative Bacterial Culture:Current Status and Potential of Next-generation Sequencing
植田 成実
1,2
,
飯田 寛和
3
,
齋藤 貴徳
4
Narumi UEDA
1,2
,
Hirokazu IIDA
3
,
Takanori SAITO
4
1関西医科大学総合医療センター整形外科
2関西医科大学総合医療センターゲノム解析センター
3関西医科大学リハビリテーション学部
4関西医科大学附属病院整形外科
1Department of Orthopedic Surgery, Kansai Medical University Medical Center
2Department of Genome Analysis Center, Kansai Medical University Medical Center
3Department of Physical Medicine and Rehabilitation, Kansai Medical University
4Department of Orthopedic Surgery, Kansai Medical University Hospital
キーワード:
人工関節周囲感染
,
periprosthetic joint infection
,
PJI
,
next-generation sequencing
,
NGS
,
定量PCR
,
quantitative polymerase chain reaction
,
qPCR
Keyword:
人工関節周囲感染
,
periprosthetic joint infection
,
PJI
,
next-generation sequencing
,
NGS
,
定量PCR
,
quantitative polymerase chain reaction
,
qPCR
pp.233-240
発行日 2022年3月25日
Published Date 2022/3/25
DOI https://doi.org/10.11477/mf.1408202275
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Next-generation sequencing(NGS)の出現は,医学・生物学に革新的なインパクトをもたらした.NGSは,ゲノム解析を短時間かつ安価で行うことを可能とし,Musculoskeletal Infection Societyによる人工関節周囲感染の診断ガイドラインでは,診断未確定の症例にNGSを考慮することが注訳として記載されている.これまで培養検査ではviable but nonculturable (VBNC) state bacteriaを検出することができなかったが,培養困難な複数細菌もNGSは1〜2日で網羅的に検出できる.しかし,NGSは相対的検査であることに注意を要し,検体に含まれる原因菌が少ない場合に精度が落ち,偽陽性を生じ得る.培養陰性の場合,抜去されたインプラント超音波処理液を含む複数検体に対し定量PCR(qPCR)などの遺伝子定量検査を行い,含まれる細菌遺伝子量の多い検体に対しNGSを行う必要がある.そして,NGS結果に対し,陽性・陰性コントロールを用いた詳細な分析を行い,さまざまなコンタミネーションに配慮し,病態に関わる細菌を特定することで診断未確定の症例にNGSを用いた原因菌の同定と診断が可能となる.
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