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雑誌
筆頭著者 服部 正平 (編)
その他の著者等 服部正平／編
羊土社
電子版ISBN
電子版発売日 2025年7月4日
ページ数 205
判型 B5
印刷版ISBN 978-4-7581-2283-2
印刷版発行年月 2025年6月
書籍・雑誌概要
あなたの扱うマイクロバイオームデータ，正しく取得，解釈できていますか？ 対象が複雑ゆえに多い研究の落とし穴を，“達人”たちが徹底フォローします．腸内細菌叢を軸に，真菌・ファージの解析や，皮膚・口腔などの微生物叢の解析まで網羅．実験の戦略や起こりうる問題への対処法を詳述し，ヒトのデータと結びつける方法も紹介しています．確かな知見を導き出すための必携書
目次
【目次】
序
1章 マイクロバイオーム研究をはじめる前に考えること
1 ヒトマイクロバイオーム研究の全体像
2 データベースの意義とその整備
3 細菌の分類と命名
2章 腸内微生物叢のマイクロバイオームデータの生産
1 微生物叢DNAの抽出技術の開発状況および酵素法プロトコール
2 腸内細菌叢DNAの抽出技術（ビーズ法プロトコール）およびライブラリ調製
3 腸内細菌叢を対象とした16S rRNA遺伝子のアンプリコンとメタゲノムの情報解析
4 腸内常在性ファージの解析・宿主細菌との相互作用
5 腸内環境の代謝オミクス分析・解析
6 腸内真菌叢のマイクロバイオーム解析
3章 その他の微生物叢のマイクロバイオームデータの生産
1 皮膚細菌叢のマイクロバイオーム解析
2 唾液微生物叢のショットガンメタゲノム解析
3 ロングリードを用いたヒトマイクロバイオームの染色体外エレメントの解析
4 古代サンプルのマイクロバイオーム解析
4章 細菌株の性質の解析
1 菌株単離・培養と選定・釣菌，保存
5章 マイクロバイオームデータの関連解析
1 ヒト遺伝子一塩基多型（SNP）とマイクロバイオームの関連解析
2 環境因子（食事，生活習慣，薬剤）や疾患とヒトマイクロバイオームの関連解析
達人への一歩
①定期的な精度管理を，その1
②定期的な精度管理を，その2
③定期的な精度管理を，その3
④ウイルス（ファージ）叢の構成比について
⑤メタゲノムデータのなかから真核生物由来のDNAを検出する手法
⑥古代DNA解析への道のり
