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メタボロミクス実践ガイド

サンプル調製からデータ解析まで、あなたに合った実験デザインと達人テクニック

メタボロミクス実践ガイド
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筆頭著者 馬場 健史 (編)

その他の著者等 馬場健史,平山明由,松田史生,津川裕司/編

羊土社

電子版ISBN

電子版発売日 2021年4月19日

ページ数 334

判型 B5

印刷版ISBN 978-4-7581-2251-1

印刷版発行年月 2021年3月

DOI https://doi.org/10.18958/9784758122511

書籍・雑誌概要

「メタボロミクスって何から始めればいいの?」「うまくデータが解析できない…」そんな悩みをもつ人を本書が成功まで導きます!プロ直伝の実験デザインのコツからテクニック,応用例まで徹底紹介した実験書

目次

導入編
1 メタボロミクス手法概説
2 メタボロミクスを実施するための重要ポイント

実践編1 試料収集,サンプリング
1 オーバービュー メタボロミクスの威力を最大化するサンプリング・試料調製のコツ
2 血液
3 尿
4 唾液
5 糞便
6 動物 in vivoの代謝情報を保持した臓器サンプルの採取法


実践編2 機器分析
I オーバービュー メタボロームデータを自力で取得したい/外部に依頼したい人のためのガイド
Ⅰ.汎用される機器分析のプロトコール
2 GC-MSを用いたメタボローム解析
3 CE-MSを用いたメタボローム分析
4 親水性代謝物のターゲットメタボローム分析
5 13C標識トレーサー解析
6 脂質メディエーターのターゲット分析

II.発展的な機器分析の紹介
8 LC/MSを用いたワイドターゲットメタボロミクス
9 イオンクロマトグラフィー質量分析(IC/MS)を用いた陰イオン性代謝物の分析手法
10 生物の生成・放出する揮発性成分のメタボローム解析
11 NMR(核磁気共鳴)スペクトルによるメタボロミクス
12 振動分光法(赤外・ラマン・近赤外)を用いたメタボローム分析
13 MALDI-MSを用いたハイスループット代謝プロファイリング


実践編3 データ解析
1 オーバービュー メタボロームデータを出す側/使う側としてのデータサイエンス・プロトコール
2 GC/MSメタボロミクスのデータ処理プロトコール
3 LC-MS/MSノンターゲットリピドミクスのデータ処理プロトコール
4 ターゲットメタボロミクスのデータ処理プロトコール
5 質量分析インフォマティクスによる未知化合物の構造推定


応用・展望編
I.応用研究
1 褐色脂肪組織におけるアミノ酸代謝と糖尿病
2 生命の脂質多様性から解き明かす病態・バイオロジー研究
3 メタボロミクスによる食道がん治療効果予測代謝物マーカーの探索
4 メタボリックフィンガープリンティングの食品機能解析への応用
5 食品分野におけるメタボロミクスの応用

II.今後の取り組み
11 [座談会]エキスパート直伝!メタボロミクス研究の歩き方
12 研究室間連携によるメタボロミクスFuture planの模索

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