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フロントランナー直伝 相分離解析プロトコール

今すぐ実験したくなる、論文にはないコツや技

フロントランナー直伝 相分離解析プロトコール
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筆頭著者 加藤 昌人 (編)

その他の著者等 加藤昌人,白木賢太郎,中川真一/編

羊土社

電子版ISBN

電子版発売日 2022年7月8日

ページ数 247

判型 B5

印刷版ISBN 978-4-7581-2259-7

印刷版発行年月 2022年7月

DOI https://doi.org/10.18958/9784758122597

書籍・雑誌概要

「これって相分離?」と悩むあなたに.精製やイメージング,動態評価,定量解析など,実績ある先駆者たちによる細胞内外での解析プロトコールを結集.さらに頻発トラブルへの対応もQ&A形式で多数掲載!

目次


レビュー編

I.概論
1 群れることの意味─非膜オルガネラの生理機能
II.基礎知識
2 アミノ酸溶液とタンパク質溶液の基本的な性質
3 Low-complexity配列による相分離・相転移機構
4 細胞内相分離におけるRNAの役割

プロトコール編
I.in vitro(細胞外)
1 精製Atgタンパク質を用いたin vitro液滴形成と蛍光観察
2 精製FUSによる相分離の顕微鏡観察と温度依存性解析
3 DNA/タンパク質相分離の再現実験
4 人工細胞中での相分離観察
5 リコンビナントlow-complexityドメインの精製法
6 ハイドロゲル結合実験によるlow-complexity配列の線維形成能の評価
7 Low-complexity配列に特異的に作用する低分子化合物 biotinylated isoxazoleと1,6-hexanediol
8 ラマン顕微鏡による相分離の定量解析
II.in vivo(細胞内)
9 細胞内液滴の形成観察とFRAPによる動態観察
10 低酸素条件下で形成する代謝酵素集合体の観察
11 タンパク質クラウディング状態の蛍光プローブによる測定
12 SNAP-tagを用いた一分子イメージング法
13 近位ビオチン標識法
14 観察した液滴の画像解析による定量評価
15 過剰発現が引き起こす相分離構造と細胞毒性の評価
16 オプトジェネティクスによる相転移の操作
III.in silico
17 液滴研究に関連したデータベースと解析プログラム

発展編
1 CARS顕微鏡 Lipid dropletsからLiquid dropletsの可視化へ
2 新たな液中走査電子顕微鏡の開発と生物試料の直接観察
3 中性子散乱
4 放射光円偏光二色性分光法による液‐液相分離の観測
5 分子シミュレーションで理解する相分離のメカニズム

索引

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