シングルセル解析によるウイルス感染ダイナミクスの時空間的理解

Spatio-temporal understanding of viral infection dynamics by single-cell analysis

　ウイルスや細菌などの感染症の世界的大流行は，生命と経済に大きな影響を及ぼす．新型コロナウイルス感染症（COVID-19）やエムポックス（Mpox）は新興・再興感染症の一例であり，今後も人類は，数多くのパンデミックを乗り越えていく必要がある．ウイルス感染症のパンデミックに対応するうえで重要となるのは，創薬などの有効な対策を迅速に見出すことにあり，感染個体内における感染の時空間ダイナミクスを多様な視点で理解することは，その一助となる．本稿ではまず，ウイルス感染症におけるシングルセル解析を用いた免疫応答の解析事例として，筆者らの行った研究である生体内におけるヒト免疫不全ウイルス1型（HIV-1）感染細胞のシングルセル解析と，自然免疫応答の動物種間比較解析を中心に取り上げる．そして最後に，近年，技術革新のあった空間オミクス解析，生細胞時系列解析，および大規模データベースやAI技術の今後のウイルス学研究での活用の展望をまとめる．これらの技術をいかしてウイルス学的課題に取り組むことで，さらなる研究の発展が期待される．