シングルセル時代のシステム生物学 -――シングルセルマルチオミクスによる遺伝子制御ネットワークの推定

Systems biology in the single-cell era ――Estimation of gene regulatory networks by single-cell multi-omics

　システム生物学は，遺伝子，タンパク質，代謝物，細胞などのネットワークを生命システムとして捉え，これらがどのように機能し，環境の変化に応じて自律的に動作するかを解明することで，生命現象を俯瞰的に理解するための研究分野である．近年，蓄積された大量のオミクスデータ，特にシングルセルマルチオミクスデータを基に，システム生物学的なアプローチにより複雑な生命システムの動作機構の解明が進んでいる．本稿では，システム生物学における重要な課題のひとつ，遺伝子制御ネットワークの推定に焦点を当て，この推定に用いられるデータ，主要な推定手法の特徴と限界，さらにはこの分野の課題について詳細に解説する．