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特集 次世代シーケンサーが可能にした感染学の新しい展開
2.NGSを使ったゲノム解析の基礎研究への応用展開 6)難培養性微生物の1細胞ゲノム解析
Single-cell genomics of uncultivable microorganisms
本郷裕一
1
Hongoh Yuichi
1
1東京工業大学生命理工学院 教授
キーワード:
環境微生物
,
環境ゲノム
,
難培養
,
シングルセル・ゲノミクス
Keyword:
環境微生物
,
環境ゲノム
,
難培養
,
シングルセル・ゲノミクス
pp.90-96
発行日 2017年6月25日
Published Date 2017/6/25
DOI https://doi.org/10.20837/2201707090
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ヒト消化管内や病理組織を含め,環境中の微生物群集は培養困難な種類を多く含んでいる。こうした難培養性微生物群は培養を前提とした従来の微生物学的手法では研究困難である。最近,真核生物あるいは細菌の1細胞からゲノムを解読する手法が確立されつつあり,多様な未培養微生物系統群のゲノム配列データが飛躍的に増加している。1細胞ゲノム解析とは,自動細胞分取装置(FACS)などで微生物を1細胞ずつ単離し,ゲノムDNAを酵素的に複製増幅して次世代シーケンサーで解析するものである。本稿では難培養微生物研究の現状と課題を1細胞ゲノム解析を中心に概説する。