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今月の特集1 次世代の微生物検査
次世代シークエンサーを用いたヒト常在菌叢の大量16S解析
High-throughput 16S analysis of human microbiota using next-generation sequencer
服部 正平
1
,
金 相完
2
,
須田 亙
1
1東京大学大学院新領域創成科学研究科
2東京大学大学院農学生命科学研究科
キーワード：
腸内細菌
,
16SリボソームRNA遺伝子
,
次世代シークエンサー
Keyword:
腸内細菌
,
16SリボソームRNA遺伝子
,
次世代シークエンサー
pp.406-414
発行日 2013年4月15日
Published Date 2013/4/15
DOI https://doi.org/10.11477/mf.1542103388
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■次世代シークエンサーの登場は，大量データをベースにした複雑な細菌叢の菌種や遺伝子の，培養に依存しない網羅的解析を可能にした．
■従来よりも高い定量性を付与した網羅的16SリボソームRNA遺伝子シークエンシングによるヒト腸内（常在）細菌叢の解析法を開発した．
■大量の16SデータのOTUとUniFrac distance解析を用いて細菌叢間の相違や細菌叢に特徴的な菌種をピンポイントで同定する方法を開発した．
■培養した細菌種の個別ゲノム解析は，16Sおよびメタゲノムデータの有効活用に必要である．
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