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雑誌
ロングリードWET&DRY解析ガイド シークエンスをもっと自由に！
リピート配列から構造変異、ダイレクトRNA、de novoアセンブリまで、研究の可能性をグンと広げる応用自在な最新技術
筆頭著者 荒川 和晴 (編)
その他の著者等 荒川和晴，宮本真理／編
羊土社
電子版ISBN
電子版発売日 2021年10月4日
ページ数 230
判型 B5
印刷版ISBN 978-4-7581-2253-5
印刷版発行年月 2021年9月
書籍・雑誌概要
精度が向上し，導入のしやすさや応用性の高さで新たな強みを示すロングリード技術を活用して新発見を掴むための実践プロトコール集．実例に裏打ちされたWET・DRY双方のノウハウが満載．
目次
序
第1章 Introduction
1 序論：誰もがゲノムシークエンシングできる時代に
2 ナノポアシークエンスの原理と技術発展
3 DRY解析環境のセットアップとデータ解析プラットフォームGalaxyの使い方
4 ナノポアシークエンス実践ガイド ライブラリプレップから解析環境選びまで
第2章 プロトコール1 リピートと構造変異
1 動物の長鎖リピート解析（クモ糸を例に）
2 ヒト疾患関連の長鎖リピート解析
3 ヒト疾患関連のSV解析
4 核酸の塩基修飾解析
5 メガベースをめざせ！ultra-long readプロトコール
第3章 プロトコール2 ゲノムアセンブリ
1 初めてでもできる！細菌ゲノムのアセンブル
2 和牛のde novoゲノムアセンブリ
3 ナノポアで読む植物ゲノム
第4章 発展的アプリケーション
1 direct RNA sequenceとRNA修飾の情報解析
2 ナノポア技術によるオンサイト迅速細菌同定
3 ナノポアシークエンサーMinIONを活用したウイルス解析
索引
