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増大号 超実践！ 病理で迫るがんゲノム医療—検査から治療まで
2章 がんゲノム検査に関わるテクニックと工程
遺伝子関連検査領域の工程
—核酸（DNA，RNA）の取り扱い—FFPEから抽出したRNAの品質と量
雨宮 健司
1,2
1山梨県立中央病院ゲノム解析センター
2山梨県立中央病院検査部ゲノム検査科
キーワード：
ホルマリン固定パラフィン包埋
,
FFPE
,
RNA
,
品質
Keyword:
ホルマリン固定パラフィン包埋
,
FFPE
,
RNA
,
品質
pp.1103-1105
発行日 2025年10月15日
Published Date 2025/10/15
DOI https://doi.org/10.11477/mf.048514200690101103
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- 参考文献 Reference
はじめに
近年，がんゲノム医療の進展によって，次世代シークエンサー（next-generation sequencer：NGS）を用いた網羅的遺伝子解析が普及している．特に，がん組織由来のRNAを解析することで，融合遺伝子や遺伝子発現，RNAスプライシング異常を捉えることが可能となった．ホルマリン固定パラフィン包埋（formalin fixed paraffin embedded：FFPE）標本から抽出されるRNAの品質は，特に固定時間や保存期間の長さによって影響を受ける．
本稿では，ホルマリン固定時間およびFFPEブロックの保存期間という2つの要因に着目し，RNAの品質と量に与える影響について筆者ら1）の研究（以下，本研究）を基に解説する．
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