連載 感染予防の実践!
2.次世代シークエンサーによる病原体ゲノム網羅解析と感染症の原因究明
黒田 誠
1
1国立感染症研究所病原体ゲノム解析研究センター
キーワード:
Next-Generation Sequencing(NGS)
,
網羅的病原体検出法
,
メタゲノム
,
RNA-seq
Keyword:
Next-Generation Sequencing(NGS)
,
網羅的病原体検出法
,
メタゲノム
,
RNA-seq
pp.51-53
発行日 2018年4月10日
Published Date 2018/4/10
DOI https://doi.org/10.34449/J0108.02.01_0051-0053
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次世代シーケンシング(Next-Generation Sequencing:NGS)による技術革新は目覚ましく,その網羅性を活用した病原体検出法に期待が高まっている.NGS検査法は検体DNA/RNAをまるごと解読して配列同定するメタゲノム解析法であり,“制限のないマルチプレックス定量PCR検査”と同等かつ網羅的に病原体を検出する核酸診断法である.NGS検査法は煩雑なプライマー設計やPCR反応条件などの最適化が全く不要であり,多様な臨床検体への検査応用がなされている.NGS技術のさらなる発展が期待され,感染症診断や公衆衛生学的病原体検索アプローチにパラダイムシフトを生じさせる可能性をもっている.「KEY WORDS」Next-Generation Sequencing(NGS),網羅的病原体検出法,メタゲノム,RNA-seq
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