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実験講座
1細胞トランスクリプトーム解析の高出力化と自動化
High-throughput and automated single-cell transcriptome analysis
團野 宏樹
1
,
二階堂 愛
1
Danno Hiroki
1
,
Nikaido Itoshi
1
1理化学研究所情報基盤センターバイオインフォマティクス研究開発ユニット
キーワード:
1細胞
,
transcriptome
,
RNA-seq
,
microfluidics
,
Docker
Keyword:
1細胞
,
transcriptome
,
RNA-seq
,
microfluidics
,
Docker
pp.178-184
発行日 2017年4月15日
Published Date 2017/4/15
DOI https://doi.org/10.11477/mf.2425200604
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1細胞トランスクリプトーム解析は,生体を構成する細胞集団に属する細胞の全遺伝子発現量を1細胞ごとに定量する技術である。1細胞トランスクリプトーム解析を行うことで,細胞集団の遺伝子発現量を,平均でなく分布として捉えることや,集団内の希少な亜集団の発見,細胞種比率の同定なども可能である。本稿では,この技術の高出力化と自動化の最前線を解説する。加えて,これらデータ解析の自動化について,仮想計算機技術を用いた新しい試みを紹介する。
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