大腸菌研究の新世紀―全ゲノムが解読されたあとの研究

Frontiers of E. coli research after genome sequencing

　1995年，インフルエンザ菌Haemophilusin-fluenzaeの全ゲノム1830kb^1）とマイコプラズマ菌Mycoplasmagenitaliumの全ゲノム580kbの配列決定^2）が報告された。以来，全ゲノムが解読された細菌は70種を超え（http://gib.genes.nig.ac.jp），わが国単独で解読された細菌ゲノムも十数種類にのぼる。解読中の細菌を含めるとすでに100種を超えている。20世紀分子生物学勃興期のモデル生物，大腸菌Escherichiacoliについては日米両国で異なる菌株でのゲノム解析が行われた。アメリカで行われた野性株K－12由来MG1655株の全ゲノム解読は1997年に終了し^3）（http://www.genome.wisc.edu/sequencing.htm），日本グループは，科研費研究班を中心に，小原ら^4）が整列クローンを構築したK－12株由来W3110株の配列に早くから着手したが，最近になって，堀内（基生研）・森（奈良先端大）らが配列決定を完成し，その全容は近く公表される（http://ecoli.aistnara.ac.jp/）。その間に，大阪・堺を中心に，病原性大腸菌O157株の集団感染が起きた。林（宮崎医大）・牧野（阪大・微研）らは，その全ゲノムの配列を決定した^5）（http://genome.gen-info.osaka-u.ac.jp/bacteria/o157/）。