マルチプレックス法によるバクテリアゲノムのde novo DNA配列解読

次世代DNAシークエンサー（NGS）の技術開発により，1解析あたり600Gb以上という超大量のDNA配列を得ることができるようになった．今後もアウトプットは増加し，バクテリアゲノムも代表的な株だけでなく，株ごとの解読も行われると考えられる．そこで，データ量の多いショートリードNGSでのマルチプレックス法を用いて複数のバクテリアゲノムのde novo DNA配列解読の結果，リピート配列以外の領域をほぼ解読することができた．本稿では，マルチプレックス法での解析の流れと，de novo DNA配列解読でのアセンブラや冗長度の条件などについて紹介する．