RNAエディティングの網羅的探索と機能解析

Genome-wide exploring A-to-I RNA editing sites in human transcriptome

ヒトのRNAにはイノシン(I)が大量に含まれていることが知られている．これは，A-to-I RNAエディティング(以下，RNAエディティングとする)という機構で生じている．イノシンはその化学構造上グアノシン(G)に類似しているため，シチジン(C)と塩基対を形成する．そのため，mRNAに生じたイノシンはしばしばアミノ酸配列の変化や，選択的スプライシングの調節，RNAの安定化制御などを引き起こしている．筆者らはイノシン特異的な化学修飾と逆転写反応を組み合わせ，生化学的にイノシン化部位を同定するICE(inosine chemical erasing)法を開発した．この手法を駆使することで，ヒト脳の転写産物中に，23,000か所以上の新規イノシン化部位を特定した．

Adenosine-to-inosine (A-to-I) RNA editing is a post-transcriptional processing event involved in diversifying the transcriptome responsible for various biological processes.　Although bioinformatic approaches have predicted a number of A-to-I editing sites in cDNAs, the human transcriptome is thought to still harbor large numbers of as-yet-unknown editing sites.　Exploring new editing sites requires a biochemical method to accurately identify inosines on RNA strands.　We have developed a chemical method to identify inosines, called ICE (inosine chemical erasing), that is based on cyanoethylation combined with reverse transcription.　We employed this method to carriy out large-scale identification of novel editing sites in the human brain transcriptome.