生命のかたちを捉えるデータ解析 -――トポロジカルデータ解析

Topological data analysis ――Finding shapes in biomedical data

　医学・生命科学データ解析分野では，新たな技術の開発により目的に応じたデータ解析を可能にする．特にデータから “かたち” の情報を得るというテーマについて，近年のトポロジカルデータ解析（TDA）の発展に伴い，可能な解析が広がってきている．本稿では，異なるスケールで生成・消滅するデータの位相的性質を統合して記録する，パーシステントホモロジー（PH）とよばれる手法に焦点をあてて解説し，さらにPHが実際の医学・生命科学データにうまく適用された具体例を基礎・臨床の多様な対象を取り上げて説明する．また，利用可能な計算ツールについてもいくつか紹介する．