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第1土曜特集 構造生命科学による創薬への挑戦
計算機から創薬へ
TargetMineによる生物学的知識の発見
Discovery of biological knowledge using TargetMine
陳 怡安
1
,
李 秀栄
1
,
水口 賢司
1
Yi-An CHEN
1
,
Suyong RE
1
,
Kenji MIZUGUCHI
1
1医薬基盤・健康・栄養研究所AI健康・医薬研究センター
キーワード:
統合データ
,
データウェアハウス
,
創薬
,
オミックスデータ解析
Keyword:
統合データ
,
データウェアハウス
,
創薬
,
オミックスデータ解析
pp.641-645
発行日 2021年8月7日
Published Date 2021/8/7
DOI https://doi.org/10.32118/ayu27806641
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遺伝子配列をはじめとする生物学的データの解析は,疾患の研究や創薬における新たな発見の鍵となる.ハイスループットなオミックス解析が急速に普及し,膨大かつ多様な生物学的データが生成されるなか,研究者がそれらを関連付けて生物学的な知識を得るための優れた解析システムが求められている.TargetMineは,種々のオミックスデータをはじめ多様な生物学的データを,統一的で均質な表現に基づき統合的に取り扱うことができる多目的データ解析プラットフォームである.ユーザーは格納されているデータを照会・ナビゲートして,単一のインターフェースで解析することができる.複雑な検索もウェブインターフェース経由で行われ,ユーザー側がスクリプトやプログラムを別途用意する必要はない.さらに,解析結果をわかりやすい出力形式で提供することで,対話を通じて新しい仮説の創出を後押しする.本稿では,TargetMineの基本と創薬研究およびオミックスデータ解析の応用例を紹介する.
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