４．臨床への応用（Clinical sequencing） ３）全ゲノム配列解析を用いた腸管出血性大腸菌の分子疫学的解析

Molecular epidemiological analyses using whole genome sequencing of enterohemorrhagic Escherichia coli

　国立感染症研究所・細菌第一部における腸管出血性大腸菌（EHEC）の全国サーベイランスでは，分子疫学解析手法としてmultilocus variable-number tandem repeat analysis（MLVA）またはパルスフィールドゲル電気泳動（PFGE）法が用いられている。これら従来法で型別困難または同一型であったEHECについて全ゲノム（WGS）解析を行ったところ，より高い精度での型別が可能であった。大規模，広範囲な集団感染事例が起こりうるEHECの調査においては，コストや迅速性の点で優れる従来法の利点を生かしつつ，WGS解析を加えることで，より詳細に集団感染関連株の特定や原因食品等の究明につながる調査が可能になると考えられる。