１．基礎編 ２）次世代シーケンサーによる全ゲノムシーケンスに基づいた近縁株間高精度SNPs検出に関する情報解析

High precision SNPs detection between closely-related bacterial strains using whole genome sequencing data

　細菌は同じ種であっても系統により毒性や薬剤耐性が異なり，株の系統分類は細菌学における重要な課題である。近年の次世代シーケンサーの普及は全ゲノムにわたるsingle nucleotide polymorphisms（SNPs）の検出と高解像度な系統解析を可能にし，基礎研究のみならず臨床使用への応用も期待されている。しかし，株間SNPの検出精度については十分な検証が成されておらず，その検出工程が煩雑であることも問題となっていた。本稿では，そのような問題の解決のために我々が取り組んでいる次世代シーケンサーのデータを用いた高精度近縁菌株間SNP検出パイプラインの開発について紹介する。