タンパク質間相互作用推定および評価のためのコンピュータシステムMIAXの応用

　信号伝達，輸送，細胞運動など多くの細胞プロセスはタンパク質間相互作用（PPI）に支配されている。近年，生命における様々なPPIネットワークを推定するため，新しい実験技術が種々開発されてきた。しかし，これらの技術は精度的な問題から適用範囲は極めて限定的である。このためコンピュータを用いた方法論が，実験結果の分析やタンパク質複合体構造の詳細な解析およびタンパク質の相互作用パートナーの推定において，決定的に重要な役割を果たすものと期待されている。また機能的ゲノム解析においても，PPIやタンパク質アセンブリを特徴づけるための新規理論に基づく方法論の構築は現在の大きな研究課題の一つである。さらに，それらの方法論に立脚した合理的薬物設計や遺伝子治療などへの応用展開の重要性は多言を要しない。このような背景から，これまで筆者らは，タンパク-タンパク，タンパク-RNA，タンパク-低分子間相互作用および複合体立体構造推定のための統合的コンピュータシステム“MIAX”（Macromolecular Interaction Assessment Computer System）の開発に取り組んできた。