腸内細菌プロファイル―見えてきた腸内細菌叢の全貌

　ヒトの腸内，特に大腸には多様な細菌が常在し，複雑な腸内細菌叢を形成している．ヒトが毎日排泄する糞便(乾燥糞便)はそのほぼ2分の1が生きた細菌で占められ，その大部分が偏性嫌気性菌である．詳細な研究によりヒトの大腸内には実に500～1,000種類，その数糞便1g(乾燥糞便)あたり約1兆個に近い細菌が棲みついていることが明らかにされている．

　21世紀に入り，腸内細菌叢の単分離・培養を介さないアプローチにより，ようやくヒトの腸内細菌叢の全貌が見渡せるようになってきた．先人の数多くの努力によって確立された嫌気培養法の応用により，腸内細菌の生態が見えたように思えたが，培養法による解析には限界があることが明らかとなった．つまり，腸内細菌叢を構成している細菌の約20～30％は培養可能であるが，残り70～80％は難培養かあるいはその菌数が少ないため，難分離の腸内細菌であると推定されたのである．