—核酸（DNA，RNA）の取り扱い—FFPEから抽出したRNAの品質と量

はじめに

　近年，がんゲノム医療の進展によって，次世代シークエンサー（next-generation sequencer：NGS）を用いた網羅的遺伝子解析が普及している．特に，がん組織由来のRNAを解析することで，融合遺伝子や遺伝子発現，RNAスプライシング異常を捉えることが可能となった．ホルマリン固定パラフィン包埋（formalin fixed paraffin embedded：FFPE）標本から抽出されるRNAの品質は，特に固定時間や保存期間の長さによって影響を受ける．

　本稿では，ホルマリン固定時間およびFFPEブロックの保存期間という2つの要因に着目し，RNAの品質と量に与える影響について筆者ら^1）の研究（以下，本研究）を基に解説する．