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雑誌
≪実験医学別冊≫
改訂 独習Pythonバイオ情報解析
生成AI時代に活きるJupyter、NumPy、pandas、Matplotlib、Scanpyの基礎を身につけ、シングルセル、RNA-Seqデータ解析を自分の手で
≪実験医学別冊≫
その他の著者等 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム／編
羊土社
電子版ISBN
電子版発売日 2025年2月5日
ページ数 446
判型 AB
印刷版ISBN 978-4-7581-2278-8
印刷版発行年月 2025年1月
書籍・雑誌概要
Pythonの定番テキストが待望の改訂！大規模データの取り扱いや図による可視化など汎用的なPythonの使い方から，シングルセル，RNA-seq解析までバイオインフォマティクスの基礎が身につきます．サンプルデータとコード見本付きで，今日から実践しながら学べます．改訂では，生成AIの活用方法やScanpyの詳細な解説を加筆し，各種ライブラリのアップデートに対応しました．
目次
【目次】
改訂にあたり
はじめに（初版）
第1章 この本の使い方と事前準備
第2章 生成AIを用いたプログラミング
第3章 Jupyter Notebookの使い方
第4章 Python速習コース
第5章 文字列処理の基本 ファイルの読み書き，正規表現
第6章 Biopythonを用いた塩基配列データの扱い方 オブジェクト指向入門
第7章 pandasはじめの一歩 表形式データの扱い方
第8章 RNA-Seqカウントデータの処理 pandas実践編
第9章 データの可視化 Matplotlib，Seabornを用いたグラフ作成
第10章 統計的仮説検定 RNA-Seqデータを用いた検定の基本からモデル選択まで
第11章 シングルセル解析（１） テーブルデータの前処理
第12章 シングルセル解析（２） 次元削減
第13章 シングルセル解析（３） クラスタリング
付録A NumPy入門
付録B Scanpyを使ったシングルセル解析
索引
執筆者一覧
