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≪実験医学別冊≫

Pythonで実践 生命科学データの機械学習

あなたのPCで最先端論文の解析レシピを体得できる!

Pythonで実践 生命科学データの機械学習
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≪実験医学別冊≫

筆頭著者 清水 秀幸 (編)

その他の著者等 清水秀幸/編

羊土社

電子版ISBN

電子版発売日 2023年4月17日

ページ数 445

判型 AB

印刷版ISBN 978-4-7581-2263-4

印刷版発行年月 2023年3月

DOI https://doi.org/10.18958/9784758122634

書籍・雑誌概要

顕微鏡画像やトランスクリプトームといった生命科学データを題材に機械学習を学べる実践書.ダウンロードしたコードをブラウザで実行できるので,wet研究者でも今日から始められます.

目次

【目次】
はじめに
コード・データのダウンロードについて

第1章 機械学習の概要とライフサイエンス研究への応用
第2章 Google Colaboratory,Pandas,Matplotlib,NumPyの基礎
第3章 教師あり学習のためのデータ前処理
第4章 scikit-learnを用いたトランスクリプトームデータの分類
第5章 PyTorchを用いたトランスクリプトームデータの分類
第6章 実践編(1):生命科学・医歯学分野の画像を用いた機械学習
第7章 実践編(2):腫瘍特異的ネオ抗原の機械学習を用いた予測
第8章 実践編(3):シングルセル解析とVAE
第9章 実践編(4):エピジェネティクスを含む多階層の統合によるがん研究
第10章 実践編(5):タンパク質の「言語」の法則を解き明かす アミノ酸配列からのタンパク質局在の予測
第11章 実践編(6):AI創薬へのはじめの一歩
第12章 発展編(1):機械学習を用いたアプタマー配列の解析と創薬
第13章 発展編(2):機械学習によるマイクロバイオームと機能未知遺伝子の解析 メタゲノム・対偶遺伝学・近傍遺伝子解析
第14章 終章:さらなる学習のためのリソース

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