RNA-seq技術を用いた遺伝性筋疾患診断

Diagnosis of inherited muscle diseases using RNA-seq

　遺伝性筋疾患に対する遺伝学的解析は，筋病理診断をもとに次世代シーケンサー（NGS）を用いたターゲットリシーケンス，全エクソームシーケンス（WES）が主流である．しかし，既存の解析では3～5割程度の診断率であり，診断率向上のため近年ではトランスクリプトーム解析が注目されている．今回，筆者らは遺伝学的に未解決なデュシェンヌ型筋ジストロフィー（DMD）/ベッカー型筋ジストロフィー（BMD）患者の骨格筋を用いてトランスクリプトーム解析（RNA-seq）を行い，種々のトランスクリプト異常を同定した．さらに，ロングリードシーケンスを併用することで複雑なゲノム，染色体レベルの構造異常の同定に至った．また，検出したイントロン変異の病的意義を判断するためにin silico解析が有用であった．このようにRNA-seqは遺伝性筋疾患において診断率を上げるための重要なツールであると考えられ，今後は網羅的解析のためのパイプライン構築が期待される．