消化管感染症の病原体検索の基礎知識

Fundamentals of pathogen detection in gastrointestinal infection

要旨

消化管感染症は，世界で最も一般的な感染症の一つであり，特に小児，高齢者，免疫不全者においては重症化・難治化するなどの健康被害をもたらす。日本国内においても，食中毒や医療感染の原因となることがあり，日常診療においては，迅速かつ正確な病原体の検索はきわめて重要となる。近年では，グローバル化の進展や国際的な移動の増加により，これまで国内ではまれだった病原体が簡単に持ち込まれる事例も増加している。また，抗菌薬使用の影響や医療関連感染などにより，腸内細菌目細菌では，薬剤耐性菌（antimicrobial resistance；AMR）を含む病原体の同定も重要なテーマとなっている。消化管感染症における病原体検索は，患者の診断・治療の方向性決定にとどまらず，施設内感染対策や公衆衛生上のリスク評価にも直結する。特に，集団発生，いわゆるアウトブレイクの際には迅速な検査と報告体制が求められる。本稿では，消化管感染症における主要な病原体とその検索手法について，基礎から最新の技術までを概説し，臨床・公衆衛生の両面から意義を再確認する。

　Gastrointestinal infections are among the most common infectious diseases worldwide, causing significant morbidity and mortality, particularly in vulnerable populations such as children, the elderly, and immunocompromised individuals. Accurate and timely identification of the causative pathogens would be essential for appropriate clinical management, infection control, and public health interventions. In recent years, advances in diagnostic techniques-ranging from traditional culture methods to molecular-based multiplex PCR and next-generation sequencing-have greatly enhanced our ability to detect and characterize gastrointestinal pathogens. This review provides a comprehensive overview of the types of pathogens involved in gastrointestinal infections and outlines the fundamental diagnostic approaches currently used in clinical and public health settings.