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近年,次世代シークエンサー(next generation sequencer:NGS)の普及によって多様性の高いヒトマイクロバイオーム全体を網羅的に解析することが可能になり,さまざまな新知見が得られている。本稿では,NGSを応用したヒトマイクロバイオームの解析である,メタ16S解析,メタゲノム解析について概説し,これらの解析手法についての基礎的データを紹介する。また,解析に使用するデータベース,検体DNA調整方法の重要性についても紹介する。
Recently, next generation sequencers(NGS)became prevalent and enable us possible to comprehensively analyze the entire human microbiome community structures including difficult-to-culture microbes. In this review, we introduce the NGS-based analytical methods of human microbiome, called “meta-16S analysis” and “metagenomic analysis”, then show several fundamental data basing these analyses. Furthermore, we also introduce the importance of database improvement used for analysis and the DNA preparation method from human samples.