メタゲノミクスによる病原体検出および微生物叢解析

Pathogen detection and microbiota analysis by means of metagenomics

　感染症は多種多様な病原微生物によって引き起こされる。次世代DNAシーケンサーの出現と，コンピュータによる情報処理能力の向上は，網羅的な病原体検出を可能としつつある。また，微生物叢解析が現実的なものとなり，現在，腸内細菌叢をはじめ，微生物叢の人体ホメオスタシスや疾患とのかかわりについての研究が活発に行われている。私たちの研究グループは，次世代DNAシーケンサー普及の初期から，この新しい技術を用いて研究を行う機会に恵まれ，以来，多くの研究者と共同して微生物学や感染症学への応用を行ってきている。本稿では，次世代DNAシーケンサーを用いたメタゲノミクスによる病原体検出および，微生物叢解析の現状と今後の展望について，私たちの経験を中心に紹介したい。