遺伝子座特異的クロマチン免疫沈降法による特定ゲノム領域結合分子の同定とゲノム高次構造解析

Identification of molecules associated with specific genomic regions and analysis of higher-order chromosome conformation using the locus-specific chromatin immunoprecipitation technology

　転写やエピジェネティック制御をはじめとするゲノム機能の発現調節機構の解明は，生命科学における主要な課題の一つである。そのためには，解析対象ゲノム領域に結合している分子を同定する技術が欠かせない。また，近年，ゲノム領域間の相互作用が，ゲノム機能発現調節に重要な役割を果たしていることが示唆されている。このようなゲノム高次構造の解析においては，相互作用しているゲノム領域を同定する技術が必須である。本稿では，特定ゲノム領域に結合している分子（タンパク質，RNA，他のゲノム領域など）を同定するために，筆者らが開発した遺伝子座特異的クロマチン免疫沈降法（遺伝子座特異的ChIP法）の原理とその応用について概説する。