HCVとその変異

1．はじめに

　HCVは変異をきたしやすいウイルスで，その遺伝子配列はきわめて多様性に富んでいる．現在までに分離され，その遺伝子の塩基配列が明らかにされているHCV株は，配列の相同性から4～6種の遺伝子型ゲノタイプにグループ分けされている．HCV遺伝子は全長約9.5kbの一本鎖のRNAであるが，HCV遺伝子内の変異は，遺伝子内に均等に起こるわけではなく，エンベロープ領域（E,E2／NS 1領域）の遺伝子変異は，5’-UTRやコア領域のそれに比し，はるかに高率である．なかでもE2／NS 1領域のN末端25～30アミノ酸残基からなる超可変領域（hyper-variable region；　HVR）は特に変異が多く，同一のゲノタイプを示すHCV株間のみならず，同一個体から分離される複数のHCV株の間でさえ多様性が認められる．