増大特集 ワクチン開発
Ⅸ.サポート機関(理化学研究所)
eQTL・caQTL解析
藤本 凜太郎
1,2,3
,
北岡 寛己
1,2
,
久野 彩
1,3
,
岡田 随象
1,2,3
Fujimoto Rintaro
1,2,3
,
Kitaoka Hiroki
1,2
,
Hisano Saya
1,3
,
Okada Yukinori
1,2,3
1理化学研究所生命医科学研究センターシステム遺伝学チーム
2東京大学大学院医学系研究科遺伝情報学
3大阪大学大学院医学系研究科遺伝統計学
キーワード:
molecular quantitative trait loci
,
QTL
,
eQTL
,
caQTL
,
ゲノムワイド関連解析
,
GWAS
,
シングルセル解析
Keyword:
molecular quantitative trait loci
,
QTL
,
eQTL
,
caQTL
,
ゲノムワイド関連解析
,
GWAS
,
シングルセル解析
pp.512-513
発行日 2025年10月15日
Published Date 2025/10/15
DOI https://doi.org/10.11477/mf.037095310760050512
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ゲノムワイド関連解析(genome-wide association study;GWAS)は,免疫学的形質に関連する遺伝的多型を同定してきたが,それらの多型が形質に影響を及ぼす分子メカニズムはいまだ多くが解明されていない。molecular QTL(quantitative trait loci)解析は,こうしたGWASで同定された遺伝的多型の機能的意義を明らかにするうえで極めて有用な手法である。本稿では,代表的なmolecular QTL解析であるexpression QTL(eQTL)およびchromatin accessibility QTL(caQTL)に焦点を当て,それぞれの理論的背景やGWASとの統合解析,今後の展望について概説する。
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