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雑誌
実験医学増刊 Vol.37 No.20
【特集】シングルセルゲノミクス
羊土社
電子版ISBN 978-4-7581-0383-1
電子版発売日 2019年12月30日
ページ数 219
判型 B5
印刷版ISBN 978-4-7581-0383-1
印刷版発行年月 2019年12月
書籍・雑誌概要
【特集】シングルセルゲノミクス 生命科学研究に大きなブレイクスルーをもたらした“シングルセルゲノミクス”の手法を用いたさまざまな研究成果と，最新の技術動向を紹介します．研究目的に適したシングルセル解析を行うための道標となる一冊です．
目次
序にかえて－個体を分解して理解するシングルセルゲノミクス
第1章 総論：プロジェクト・技術の動向
1．シングルセルゲノミクスのプラットフォーム
2．医学・生物学研究に実装されるシングルセルゲノミクス
3．シングルセルRNA-seq情報解析最前線
4．世界と日本におけるHuman Cell Atlasの構築
第2章 シングルセル解析によるバイオロジー
Ⅰ．発生・臓器・オルガノイド
1．心筋シングルセル解析による病態解明から臨床応用
2．腸管上皮のシングルセル解析
3．肝臓オルガノイドのシングルセル解析
4．単細胞レベルでの膵内分泌細胞の不均一性と機能解明
5．シングルセル解析で広がるヒト腎臓発生と病態の理解
6．シングルセルRNA-seqを用いた肺線維症の解析―データベースを用いた具体的な解析方法の紹介
Ⅱ．免疫・がん
7．シングルセルレベルでのT細胞受容体・B細胞受容体解析
8．T細胞におけるシングルセル解析
9．レンバチニブと抗PD-1抗体の併用による腫瘍免疫調節作用の解析
10．大腸がん組織を構成する細胞集団の多様性
11．シングルセル遺伝子発現解析からみえてきた腫瘍内不均一性
12．成人T細胞白血病研究におけるシングルセル解析の有用性
13．HTLV-1感染動態の数理モデル型定量的データ解析
14．リキッドバイオプシーの実現に向けた血中循環腫瘍細胞のシングルセル解析
Ⅲ．その他
15．iPS細胞のシングルセル遺伝子発現解析
16．1細胞RNA-Seqによる神経前駆細胞の制御機構解析の動向
17．ウイルス感染細胞の不均一性（heterogeneity）の網羅的描出
18．メタゲノムデータからの微生物ゲノムの再構成
第3章 技術開発
1．進歩を続ける1細胞トランスクリプトーム計測法
2．シングルセルゲノム情報解析の基盤技術
3．クロマチン挿入標識法（ChIL）による単一細胞エピゲノム解析
4．シングルセル遺伝子発現解析（Nx1-seq）と細胞集団
5．C1 CAGE法を用いた一細胞転写開始点解析
6．マイクロバイオームのシングルセル解析
7．蛍光イメージングによる網羅的シングルセル解析
8．SINC-seq法による1細胞多階層解析
