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Journal of Clinical and Experimental Medicine Volume 286, Issue 3 （July 2023）

医学のあゆみ 286巻3号（2023年7月発行）

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特集ヒト細胞アトラスプロジェクトの現在地

機械学習を用いたシングルセル・空間的遺伝子発現の解析 Machine learning for single cell and spatial transcriptomics 清田純 ¹ Jun SEITA ¹ ¹理化学研究所統合情報本部先端データサイエンスプロジェクト，同生命医科学研究センター，同情報統合本部基盤研究開発部門キーワード：機械学習 , シングルセル遺伝子発現解析 , 空間的遺伝子発現解析 Keyword: 機械学習 , シングルセル遺伝子発現解析 , 空間的遺伝子発現解析 pp.209-211

発行日 2023年7月15日 Published Date 2023/7/15

DOI https://doi.org/10.32118/ayu28603209

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Abstract 文献概要
1ページ目 Look Inside

　Human Cell Atlas（HCA）プロジェクトでは，これまでにない規模でシングルセルレベルでの遺伝子発現データが蓄積されている．数万×数万次元のデータを人間が直接解釈していくことはきわめて困難で，それを解析して意味のある知見を導き出すためには，データ駆動型である機械学習の役割がきわめて重要となる．本稿では，HCAプロジェクトのどのような場面でどのような機械学習手法が用いられているのか概観し，今後の展望について考察する．