特集 体内の細菌が作るもう一つの世界:マイクロバイオームの驚異
統合オミクスによる腸エコシステムの全容理解に向けた取り組み
福田 真嗣
1
,
大野 博司
1慶応義塾大学先端生命科学研究所
キーワード:
Bifidobacterium
,
大腸菌感染症
,
細菌遺伝子発現調節
,
疾患
,
質量分析
,
腸
,
Escherichia coli O157
,
共生
,
DNA配列分析
,
プロバイオティクス
,
メタゲノム
,
腸内細菌叢
,
代謝産物
Keyword:
Gastrointestinal Microbiome
,
Bifidobacterium
,
Disease
,
Escherichia coli Infections
,
Intestines
,
Mass Spectrometry
,
Symbiosis
,
Gene Expression Regulation, Bacterial
,
Sequence Analysis, DNA
,
Escherichia coli O157
,
Probiotics
,
Metagenome
pp.1138-1142
発行日 2013年10月22日
Published Date 2013/10/22
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次世代シークエンサーや質量分析計などのハードウェアの発達に伴い,それらを利用した生体分子の網羅的解析手法が確立されてきている.これらオミクス解析手法を適用することで,ヒト腸管内に生息している多種多様な腸内共生細菌群のカタログ化やそれらの細菌群がどのように機能して宿主生体に影響を与えているのか,といった宿主- 腸内共生細菌間相互作用の詳細に関する知見が徐々に蓄積しつつある.本稿では,腸内共生細菌叢のメタゲノム情報に加えて,代謝物情報や発現遺伝子情報を加味した統合オミクスによる,腸エコシステムの全容理解に向けたアプローチについて紹介する.
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