特集 モチーフ・ドメインリスト
2.遺伝子発現
転写および関連事象
Relホモロジードメイン
多留 偉功
1
,
馳 桃子
1
,
鈴木 利治
2
Hidenori Taru
1
,
Momoko Hase
1
,
Toshiharu Suzuki
2
1東京大学大学院薬学系研究科神経生物物理学教室
2北海道大学大学院薬学研究科ゲノム機能学講座神経科学分野
pp.386-387
発行日 2001年10月15日
Published Date 2001/10/15
DOI https://doi.org/10.11477/mf.2425902303
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[アミノ酸配列]
Relホモロジードメイン(RHD)は約300アミノ酸からなるドメインである。RHD全体でみるとアミノ酸配列上であまり高い相同性はみられない。例えばNF-κBのRHDとNF-ATのRHDとの間では20%程度である1)。
ここにRHDのコンセンサス配列としてデータベースPfamのCD-Browser(Web site:www.ncbi.nih.gov/Structure/cdd/cddsrv.cgi?uid=pfamOO554)に示されている,GPYLEITEQPKQRGMRFRYKCEGRSAGSIPGESSTKGTKTFPTIEICNYDGPAKIVVSLVTKDEPHRPHPHSLVGKDCKDGICEVELGPEDMVLSFQNLGIQCVKKKEVEEALEERIQRNIDPFNAGQEAKHQIKEMDLNVVRLCFQAFLPDQHGNFTRPLPPVVSDPIYDK(“pfam 00554”)を一応のコンセンサス配列としてあげておく。
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