PCRにおけるプライマー・プローブ設計の注意点—SARS-CoV-2遺伝子検査・変異株スクリーニング検査を理解するために

はじめに

　SARS-CoV-2（新型コロナウイルス）感染者数の増減が繰り返されている．感染の繰り返しは，ウイルス株の変化（変異株）も起因している．ウイルスは高率に塩基配列の置換を起こし，懸念される変異株（variants of concern：VOC）に分類された場合，種類の判別が必要となる．変異株の種類に関係なくSARS-CoV-2を検出・検査していくなかで，VOCである変異株を判別・検出しなければならない“時期”がある．本稿では，SARS-CoV-2遺伝子検査および変異株スクリーニング検査を理解するためにプライマーとプローブの設計上の注意点を踏まえ，塩基配列を特異的に検出する方法について概説する．