SWATH-MS法を利用した金属輸送体の機能解析

SWATH-MS-based functional analysis of metal transporters

　mRNA発現量は，タンパク質の発現量に必ずしも相関しない。機能する場（オルガネラなど）における存在量を知るためにも，タンパク質発現量は必須の情報となる。Sequential window acquisition of all theoretical fragment ion spectra mass spectrometry（SWATH-MS）法は，網羅的にタンパク質の発現量（5,000-10,000種類程度）を定量できる技術である。極めて精度が良く，1.1倍程度の発現量変化もしっかり有意差を示すほど個々のタンパク質の発現量変化を定量でき，ライフサイエンス領域におけるプロテオミクスの価値を飛躍的に上げるものと期待されている。本稿では，SWATH-MS法について概説すると共に，金属輸送研究への応用例について紹介したい。